肚脐上方和下方疼痛的原因主要有以下几种：1、慢性阑尾炎，其主要是由于阑尾管腔的粪石梗阻，导致的炎症反复发作，症状为肚脐上下方的阵发性的隐痛，可伴有腹泻、发热的症状，通过腹部的CT以及结肠钡剂灌肠，造影48小时摄片对比可辅助诊断。2、肠道的炎症、肠道的息肉以及肠道的炎性相关疾病，如溃疡性结肠炎、克隆氏病也会诱发肚脐上方和下方的疼痛，此种疼痛多伴有大便的改变，如腹泻、大便次数增多、大便变软不成形、有血或有黏液等。3、妇科的相关疾病，如子宫肌瘤、盆腔炎也可导致肚脐上方和下方的疼痛。4、膀胱炎、输尿管结石等也会导致肚脐上方和下方的疼痛，可通过腹部彩超或泌尿系的彩超辅助诊断。