补牙洞需要1-4次完成，牙洞比较表浅，位于釉质和牙本质层内时，可以直接磨除腐坏牙体组织，制备洞型，采用玻璃离子水门汀等充填。
如果牙洞深度接近髓角，出现冷热刺激痛，可以先应用丁香油氧化锌暂时封闭窝洞。疼痛缓解后再进行双层垫底，修补缺损。如果龋洞内暴露牙髓，引起牙髓炎或根尖周炎时，可以在局麻下摘除牙髓，使用3%过氧化氢溶液冲洗根管，放置药棉加快引流。2-3天后疼痛消退，可以进行根管预备、消毒，使用牙胶尖密闭管腔，封闭窝洞，整个操作过程约需3-4次。