盐酸氟桂利嗪胶囊根据治疗或预防疾病的不同，剂量有所不同。具体来说，如果用来作为偏头痛预防性治疗的话，起始剂量一般会要求每天晚上两粒，一粒是5mg，也就是说每天晚上吃10mg。如果是65岁以上的患者，每天晚上只能吃一粒。如果在治疗过程中发现患者出现了抑郁，椎体外系的反应，或者其它严重的不良反应的话，应该及时停药。而且这个药如果要是治疗两个月以后疗效没有明显的改善，也要考虑停药。
如果说是偏头痛预防性治疗的维持治疗，也就是疗效满意，患者需要长期维持，应该减至每七天连续给药五天，然后停药两天。但是具体的药物的剂量跟起始剂量是相同的，也就是说65岁以下的患者每天晚上两粒，65岁以上的患者每天晚上一粒，如果耐受性好，可以连续治疗六个月。盐酸氟桂利嗪另外一个治疗作用是用于眩晕的治疗，眩晕的治疗剂量和偏头痛的预防性治疗是相同的，但是应该在控制了眩晕症状以后及时的停药，疗程不能超过两个月。