母亲是乙肝小三阳，所生育的孩子也有可能感染乙肝病毒，因为乙肝病毒可通过母婴垂直传播，主要包括在妊娠宫内感染以及分娩和哺乳期间，将病毒传播给胎儿或新生儿，所以乙肝小三阳的妇女要在备孕前进行咨询，专科医生按照程序正规的进行母婴阻断，主要包括孕期阻断和产后阻断两方面。首先是在孕期，如果病毒量比较高，应该口服核苷类的药物降低体内病毒含量，减少宫内感染几率。自妇女怀孕24-28周开始，在医生指导下定时、定量服用抗病毒药物，直到生产后一个月。
产后阻断是指对新生儿注射乙肝疫苗和乙肝免疫球蛋白，最好是在出生后两小时内注射乙肝免疫球蛋白和第一针乙肝疫苗，最晚不要超过24小时，越早越好。注意疫苗和乙肝免疫蛋白要注射在不同部位，出生一个月、六个月时再分别注射一针乙肝疫苗，通过这样的处理，98%以上的母婴垂直传播可以有效的被阻断。