发生肛门瘙痒，最直接的原因是肛门直肠疾病，比如痔疮、肛瘘、肛裂、肛窦炎、肛门失禁等。以上疾病或者直接刺激肛门腺，导致肛门腺体分泌物增加，或者间接引起肛门关闭不严，导致直肠分泌物外溢。最终引起肛门潮湿，肛门皮肤潮湿的环境又给细菌和真菌的寄生创造了环境，共同作用引发肛门瘙痒。另外，辛辣食物的过量摄入，肥胖，臀沟过深，多毛症，焦虑也是肛门瘙痒的间接发病原因。女性患者患有阴道炎，也是女性发生肛门瘙痒的重要原因之一。