扁桃体炎的最佳治疗方案涉及两个方面，一个方面是适合的病情，另一个方面是适合的个体。对于急性扁桃体炎，尤其是化脓性的扁桃体炎，主要是抗感染治疗，用头孢抗生素和糖皮质激素，但如果是对于孕妇患者，不能用糖皮质激素，可以用头孢抗生素和维生素类的药物。如果反复的发作扁桃体炎，多数采取手术治疗，手术主要是双侧扁桃体摘除术。对于伴有其他的疾病，如血液性的疾病，扁桃体摘除需要非常慎重。