锁骨钉根据其内固定的位置、制作的材质和工艺，以及取钉的早晚，会产生相应的不良反应。如果锁骨钉放置在肩关节周围，接近肩袖周围肌腱、韧带的止点或者走行区，会造成肩袖的慢性损伤，产生炎症，从而影响肩关节的活动度。如果锁骨钉是普通的钢钉，会产生明显的身体免疫排斥反应，局部会产生免疫性的炎症，造成疼痛、骨折不愈合，钛合金的锁骨钉免疫排斥反应较小。如果锁骨钉长期不取，会造成局部的应力遮挡，时间长了局部出现骨质疏松，而且由于长期疲劳，锁骨钉会发生断折，骨质疏松的部位可能会出现再骨折。