益生菌有多种功效，可以防治腹泻，缓解乳糖不耐受症状，预防阴道感染，增强人体免疫力，缓解过敏作用，降低胆固醇等，是平衡胃肠道菌群最直接有效的方法。
常用的益生菌有乳酸菌、双歧杆菌、嗜酸乳杆菌、放线菌、酵母菌，例如阿泰宁、常立宁、思连康、培菲康、丽珠肠乐、金双歧。
也可以多吃一些馒头、醪糟、酸奶、优益乳、米酒，这都是天然益生菌发酵的产物，可以在日常当中适量的多吃一些。但是应该注意益生菌不可以长期服用，不可滥用，避免产生依赖性、抗药性，反而加重便秘、腹泻的症状。