乙肝三对半和乙肝两对半的区别，主要是乙肝三对半比乙肝两对半多了两项检查，包括乙肝核心抗体IgG剂和乙肝核心抗体IgM。如果是乙肝核心抗体IgM阳性，可以区分是新近感染。如果IgM是阴性，而IgG是阳性，则可以提示是一个慢性化的感染过程。
临床中，最常见的还是乙肝两对半，也就是乙肝五项的检查。主要是检查乙肝表面抗原、乙肝表面抗体、乙肝E抗原、乙肝E抗体，还有乙肝核心抗体的定性检测，一般是阳性或阴性，根据这五项检查可以推测乙肝病人目前所处的状态，即是大三阳，还是小三阳，需要配合乙肝病毒DNA检测以及肝功能的检测，这样可以看到乙肝病人目前是否需要立刻抗病毒治疗，还是定期观察、检测即可。同时乙肝五项定量还可以根据乙肝表面抗体的定量，来判断是否需要打疫苗，是否需要打加强针，以及是否产生了足够的抗体，能预防乙肝病毒的感染。