小分子肝素和普通肝素的不同，包括以下几个方面：
1、分子量：小分子肝素的分子量比较小，一般在5000D以下。普通肝素的分子量比较大，一般在5000-30000D。
2、副作用：在临床中用于抗凝时，这两种药物都比较常用，小分子肝素的副作用更小，普通肝素副作用相对较大，会有血小板的减少和出血。
3、价格及半衰期影响：小分子肝素的价格比普通肝素要贵，所以，如果临床中不考虑价钱因素，建议选择小分子肝素作为抗凝药物。因为它对血小板的影响较小，可能引起出血的风险也小，而且小分子肝素的半衰期也比普通肝素的半衰期要长。