直肠阴道瘘治疗的目的是闭合瘘管，避免复发同时保护肛门括约肌的功能，缩短愈合的时间。由于瘘口迁延不愈，在滋生有大量细菌的粪便的长期刺激下，往往合并有不同程度的局部炎症，而且瘘口周围常以形成纤维瘢痕组织，因此保守治疗常常难以奏效，手术修补是直肠阴道瘘唯一的治愈手段。直肠阴道瘘保守治疗是无效的，手术是唯一的治疗手段，根据阴道瘘的不同类型、瘘口大小可以选取不同的手术方式，手术的目的是恢复有正常控制能力的排便功能。直肠阴道瘘由于病因比较复杂，种类也比较多，手术后感染复发率高，手术难度很大，要达到一次性的成功，慎重的选择手术时机和手术方式是很重要的。直肠阴道瘘分为先天性阴道瘘和后天性的直肠阴道瘘，但是如果想一次性成功还是比较困难的，一般情况下要进行2-3次的手术才可能成功。