睡眠障碍鉴别的依据，主要可以通过临床表现来判断属于哪种形式的睡眠障碍，还有通过多导睡眠来判断属于哪个睡眠阶段出现的睡眠障碍，再通过相关的疾病检查来判断睡眠障碍是属于疾病相关性，还是神经递质异常的等等来进行鉴别。
一般来说，可以通过临床表现是发作性失眠，还是睡眠增多等进行判断。再根据多导睡眠判断出是睡眠的深睡眠期，还是快速眼动睡眠期的睡眠障碍。通过血液以及相关的检查找到病因来进行确诊，属于哪种形式引起的病因。