女生小肚子疼的原因有以下几种：由于肠道方面的疾病，包括肠炎、肠痉挛、肠梗阻、肠胀气等等胃肠功能方面的疾病。可以通过相关的检查明确诊断，诊断明确以后可以对症治疗。另外，女生小肚子疼，考虑有妇科的疾病，包括盆腔炎、宫颈炎，还有附件炎，甚至有卵巢囊肿等等，也能够引起小腹疼痛，要及时到专科医院去进行诊断和治疗。女生小腹疼痛也有可能是痛经，这在很多年轻的女性都发生，一般是在例假来的时候伴随有明显的腹痛，可以通过一定的药物调节，等到例假结束，疼痛也就消除了。