拔完智齿后还是会隐隐作痛，原因主要包括以下几个方面：
1、在拔除埋伏阻生智齿或水平横向阻生智齿时，需要切开软组织，磨除部分骨质，手术创伤较大，能够引起明显的肿痛，疼痛时间较长。
2、拔牙窝过深时，远中牙根会暴露在创口内，遇冷热刺激出现酸痛。2-3个月新生骨质覆盖根面后，疼痛才能缓解。
3、如果拔智齿时用力过大，导致邻牙发生牙周震荡，牙周膜出现肿胀，2-3周内会长期存在钝痛。
4、邻牙部分牙体组织发生崩折时，对温度刺激较为敏感，需要尽快修补，缓解疼痛。