干燥综合征主要引起外分泌腺病变，同时也可引起多种系统性损害的临床症状。累及外分泌腺可以出现口干燥症，表现为口干、舌体干燥、猖獗龋齿、腮腺反复肿大。眼干燥症表现为眼干涩、异物感、泪少、畏光、视力下降等。出现呼吸、消化道、阴道、皮肤等部位的干燥症状；累及多个系统，出现相应系统的临床症状。
累及皮肤黏膜可以出现双下肢的紫癜、结节红斑、口腔溃疡等。累及关节肌肉，可以出现肌肉关节的疼痛；累及消化系统可以出现转氨酶的升高，肝脾的肿大；累及肾脏可以出现肾小管酸中毒、低钾性麻痹、肾结石、尿蛋白等。
累及神经系统，可以出现肢体的麻木、疼痛、意识障碍、癫痫发作等；累及呼吸系统可以出现干咳、胸闷、喘憋；累及心脏可以出现心包积液、心衰等；累及淋巴组织可以出现淋巴结的肿大，并可以转化为淋巴瘤；累及血液系统，可以出现全血细胞的减少。