如果在临床上诊断出生化妊娠，40多天阴道流血还没有干净常是以下原因造成。第一个原因是感染造成，出现生殖道感染或者子宫内膜感染会出现阴道流血不干净，并且还会出现下腹部疼痛或者阴道分泌物有异味的情况。建议做妇科检查可以做出初步诊断。第二个原因是宫腔内有残留的血块，残留的血块没有及时排出影响子宫收缩，会造成阴道流血淋漓不尽的情况。通过B超检查可以了解宫内情况，必要时需要给予清宫手术，并且将清除的组织物送病理化验，临床以病理诊断为准。