引起功能性子宫出血的原因有心理因素，不良精神创伤导致。HPO轴功能失调，包括生殖激素释放节律紊乱、反馈功能失调、排卵和黄体功能障碍。内分泌和代谢紊乱，如缺铁、贫血、再生障碍性贫血、血液病等。
子宫和子宫内膜的因素，还有医源性因素，包括服用避孕药，宫内节育环影响月经的功能。营养不良因素，爱偏食女性朋友更容易患功能性的子宫出血。