扁桃体发炎的实验室检查常规化验血常规、C反应蛋白、降钙素、支原体检查，做咽拭子以及分泌物的培养。根据化验结果，明确致病菌以后再选择敏感的药物积极的控制炎症。在临床中，对于扁桃体发炎最常见的还是由于溶血性链球菌、金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌等革兰氏阳性菌感染为主。如果是细菌感染，而且感染比较严重，血常规或者C反应蛋白，从血象上白细胞会明显的增高，C反应蛋白值也会明显超过正常值。做咽拭子以及细菌培养也会培养出细菌，所以对于扁桃体发炎选择敏感的抗生素积极控制炎症。