按婴儿拉肚子的病因，分为感染性及非感染性的病因。感染因素，肠道内感染可以有病毒、细菌、真菌、寄生虫引起，其中以病毒和细菌最常见，尤其是病毒，最常见的病毒由轮状病毒或者是诺如病毒；细菌感染由大肠埃希菌引起来的，还有空肠弯曲菌及沙门菌等。还有就是寄生虫感染引起来的，最常见有阿米巴痢疾。还有一种就是非感染因素引起来的，主要就是饮食因素，喂养不当引起来的腹泻，这个多为人工喂养儿。另外现在很常见的过敏性的腹泻，如对牛奶蛋白、大豆蛋白过敏引起来的腹泻；还有气候因素，气候突然变化，腹部受凉，使肠蠕动增加引起的腹泻。