很多患者是经过体检才发现得了脂肪肝，脂肪肝的验血项目包括肝功能的检查，及血糖、血脂，并且首次检查需要进行丙型肝炎的病毒学检查，因为有些肝病可合并脂肪肝，例如丙型肝炎可以合并脂肪肝。同时脂肪肝的诊断也需要排除其他病因引起的肝损伤，例如自身免疫性肝病、药物性肝炎等。
必要的时候需要进行肝穿的组织学检查进一步诊断，目前的影像学检查以及肝脏弹性的检测可以部分取代肝穿，更有利于脂肪肝的临床诊断，所以脂肪肝的诊断是通过病人的病史以及采血、影像学综合诊断。