万古霉素和去甲万古霉素均属多肽类化合物，化学结构相近，作用相似，后者略强，两者不同之处具体如下：
1、万古霉素由东方链球菌培养液中提取所得，而去甲万古霉素由放线菌所得。
2、结构式不同，去甲万古霉素比万古霉素少一个甲基。
3、作用强度不一样，0.4g去甲万古霉素相当于0.5g万古霉素。
这两种药物仅对革兰氏阳性菌有强大的杀菌作用，抗菌机制为阻碍细菌细胞壁的合成，细菌对本产品不产生耐药性，并且与其他抗生素无交叉耐药性，口服不吸收，粪便中浓度高，药物广泛分布于各组织，主要经肾排泄。万古霉素和去甲万古霉素主要用于治疗耐青霉素的金黄色葡萄球菌感染引起的败血症、肺炎、心内膜炎、结肠炎，及其他抗生素，尤其是克林霉素引起的假膜性肠炎。静脉滴注时偶尔可发生恶心、寒战、药物热、皮疹及皮肤瘙痒等，较大剂量严重者可致耳聋、耳鸣及听力损害。