鉴于导致上呼吸道感染的病原体中，大部分也就是80%或80%以上都是病毒感染，故阿奇霉素不可以用来治疗上呼吸道感染。如果确定上呼吸道感染不是病毒感染导致，可以考虑使用阿奇霉素。难点是临床鉴别上呼吸道感染是否是病毒感染者导致有一定困难，通常可以依据是否有发热、伴脓鼻涕或化脓性扁桃体炎而定。
阿奇霉素是一种广谱抗生素，适用于各种革兰氏阳性球菌导致的呼吸道、泌尿道、生殖系统等感染。阿奇霉素半衰期比较长，上呼吸道感染中病毒感染导致的可能性比较多，阿奇霉素无效。为了避免阿奇霉素的不良反应，避免阿奇霉素耐药，治疗上呼吸道感染不需要首选阿奇霉素，除非患者上呼吸道感染是细菌感染所导致。