偏头痛的治疗先要考虑头颅问题，如头颅、脑组织本身问题或脑血管问题，需要做头颅核磁共振检查、头颅血管核磁共振检查。排除颅内器质性病变导致的偏头痛后，先考虑颈源性头痛，需要行颈椎核磁共振检查。
轻度偏头痛可以通过口服药物来治疗，普通止痛药如扑热息痛、布洛芬、曲普坦类药物等。如果药物控制效果不好，可以行颈椎椎旁神经阻滞、小关节阻滞或颈椎硬膜外注射等等。
如果是由于蝶腭神经痛导致的偏头痛，需要对蝶腭神经节进行神经阻滞。同时要关注心因性的偏头痛，需要行心脏冠状动脉造影检查后来确诊，这类的头痛在对症治疗的同时，要注意对因治疗。