胎儿室间隔缺损建议做染色体检查，注意胎儿的染色体是否正常。如果在怀孕中期做彩超发现胎儿室间隔缺损，建议进一步做胎儿心脏彩超，测量室间隔缺损的程度。如果是小缺损，一般对胎儿的影响比较小，建议做羊水穿刺，注意染色体的情况。如果染色体正常，建议每个月复查胎儿心脏彩超，注意室间隔缺损的变化程度。胎儿生后要到心脏外科进行咨询，可能需要做手术进行纠正。另外，需要做详细的胎儿三维彩超，注意胎儿其他脏器是否同时合并有畸形。
对于特别严重的室间隔缺损，如果伴有明显的染色体异常，建议终止妊娠，放弃胎儿，因为此种胎儿生后很难纠正，预后不好。