幼儿急疹的发病机制目前尚不明确，人类疱疹病毒-6型，即HHV-6感染是幼儿急疹最常见的病因，其次是HHV-7感染。幼儿急疹主要通过接触受感染的呼吸道分泌物或唾液，在人与人之间进行传播，HHV-6感染是婴幼儿最常见的病因，还有肠道病毒，比如柯萨奇病毒A型、柯萨奇病毒B型、Echo病毒、腺病毒以及副流感病毒都可以感染。
幼儿起疹常常的发病年龄在6-15个月，6个月以内的婴幼儿急疹的机会比较大，是因为小婴儿从母体接受的抗体可以保护他们免疫许多病毒感染，但这种从母体获得的免疫力随着时间的推移，6个月以后就减少，所以发病年龄常常在6个月以后多见。