颌骨囊肿手术后，骨头可以自行愈合，颌骨囊肿的形成，是因为牙源性或非牙源性产生的炎症性或发育性的骨质破坏而形成的囊肿。颌骨囊肿的治疗主要有两种，一个是开窗手术，另一个是囊肿的彻底刮治。囊肿彻底刮治之后，会形成一个骨腔，对于骨腔的处理，原则上小的骨腔可以填塞一些骨粉等成骨材料来促进骨折生长、愈合。对于比较大的骨腔，只需要填塞止血材料，促进局部血凝块的形成，后期进一步机化成为骨组织，创口进行严密的缝合，局部进行加压。
对于比较大的颌骨囊肿，甚至波及到整个下颌骨，下颌骨容易发生病理性骨折的情况。这种情况下的颌骨囊肿，需要采取开窗手术治疗，开窗需要制作塞治器，或者囊腔里边填塞碘仿纱条，使骨质由里往外进行生长，达到一定的范围之后，对于比较小的骨腔或者囊肿，需要二次手术进行彻底刮治，刮治后的创面可以自行愈合。另外，对于颌骨囊肿刮治术还有一个要求，切口下必须有骨壁的支持，可以促进局部创口的愈合。