藿香蓟花色雅致，具有很好的观赏价值，经常被用来作为观赏植物。但是从中医的角度来说藿香蓟具有一定的药用功效，藿香蓟可以用来治疗感冒发热、头痛等症状，具有清热解毒、活血止痛的效果。对于外感风热所导致的咽喉肿痛、鼻腔流涕、头晕、头痛都具有一定的清热解表的功效。对于蚊虫的叮咬甚至舌的咬伤都有一定的清热解毒、消肿的效果。在非洲及美洲的地区有用藿香蓟的全草清热解毒、消炎止血，甚至来治疗女性的崩漏出血，据说有比较好的效果。中国民间多用此草来治疗感冒发热、疖肿、湿疹，还有烧烫伤和外伤出血等。