小儿抽动症的治疗，包括药理治疗和心理治疗两部分。心理治疗要加强支持心理治疗，解除患儿各种的心理困扰，使患儿正确认识怎么处理遇到的问题，和同学们之间的关系相处，积极配合治疗，还要让老师和家长正确认识抽动症孩子的情况，合理安排患儿生活，避免各种诱发抽动症的原因发生。
另外，药物治疗，一般心理治疗的情况下要进行药物治疗。药物治疗主要是对于抽动症的症状，针对并发症的治疗，针对抽动症症状的治疗，选用氟哌啶醇、盐酸硫必利和盐酸可乐定。此外，还有利培酮、盐酸氟西汀、氯硝西泮、肌酐治疗，对抽动症也有一定疗效。针对伴有障碍和症状的治疗，对于伴发多动症的患儿，可以选用盐酸可乐定，如疗效不显著时可选用抗抑郁的药物。对于伴发强迫症的患儿，可选用盐酸氯丙咪嗪、盐酸曲舍林、盐酸氟伏沙明等治疗。