咽峡炎最佳的治疗方法是根据病因治疗，效果才好。咽峡炎可能会有细菌感染或者病毒感染的存在，细菌感染往往以球菌类的更常见，以链球菌、葡萄球菌、肺炎双球菌等等感染比较多见。敏感的抗菌素是使青霉素或者头孢类的抗菌素，可以根据症状严重情况，可以口服或者静脉输液。
还有病毒感染存在的可能，病毒感染常见的有柯萨奇病毒、腺病毒、副流感病毒等等。要根据医生检查的情况，根据血项的化验结果，如果白细胞有增高，中性粒细胞有增高，往往是细菌感染的可能。如果血象正常，白细胞总数、中性粒细胞不高，可能是病毒感染。如果症状严重需要用抗病毒的药物，同时要注重一般的治疗，卧床休息、避免熬夜、避免劳累、多喝水、饮食清淡。