乙脑活疫苗分为乙脑减毒活疫苗和乙脑灭活疫苗两种，接种对象为六个月以上儿童。灭活疫苗相对来讲首次接种的不良反应比较少，因为病毒已经灭活了，但是再次或者第二次或第三次种的时候，不良反应比较高，主要是头昏、荨麻疹、瘙痒等免疫反应，这是一种变态反应。
减毒活疫苗的不良反应发生低，主要包括局部的和全身的症状，局部的症状可以有红、肿、热、痛，像一种炎症反应，因为它毕竟是个活的病毒，因此容易诱发局部的症状。全身发烧来讲应该也是一个常见的症状，体现出一种病毒血症。灭活疫苗的除了有过敏史不能注射之外，急性发热和其他慢性病的或者有其他神经系统的也不能接种。而减毒疫苗除了刚才说的这些禁忌症以外，有免疫缺陷的病人或正在进行免疫抑制的，比如肾移植、肝移植的病人，或者恶性肿瘤的病人，极易引起病毒播散和引起脑炎，也不太适合接种。