治疗手指疣的办法有外用药和物理治疗两种办法，而系统用药多见于比较严重的患者或久治不愈的患者，所以对于这种情况需要积极治疗。外用药包括维A酸软膏，适合扁平疣，氟尿嘧啶软膏也可以治疗，但可以留下色素沉着，所以不要用在长期暴露的皮肤，防止影响形象，当然面部更加谨慎使用。物理办法治疗包括冷冻、电灼、刮除和激光等，适用于皮肤数目较少者。系统用药一般有免疫调节剂，包括干扰素、左旋咪唑等，中医以清热解毒、散风、平肝、散结为治疗原则。