肌腱炎的治疗，包括保守治疗和手术治疗。
对于小关节处的肌腱炎和大关节的轻度肌腱炎，可以通过局部制动、口服消炎止痛药、热敷、理疗、红外线照射及中医的方法进行治疗，从而减轻肌腱炎的急性炎症疼痛。
当肌腱炎合并严重的肌腱撕裂，甚至出现肌腱断裂，譬如肩袖的肌肉炎症严重影响关节的活动，进而影响生活和休息，就需要进行手术治疗。手术治疗包括微创的肌腱清理术，以及肌腱修复术。