中枢神经血管炎如果明确诊断，通过积极的治疗，能够控制寿命跟正常人一样。如果通过积极的治疗，一般用免疫球蛋白或者血浆置换和激素的治疗，可以改善中枢性血管炎。然后通过康复训练会逐步恢复到正常，寿命没有多大影响。
如果没有积极的治疗，或者反复发作性，因为免疫功能紊乱而出现中枢神经血管炎，造成严重的症状和功能障碍，会引起并发症。最常见的并发症有肺部感染、尿路感染，部分有吞咽困难的人，会出现窒息，会影响寿命，发生意外而死亡。