肺部炎性肉芽肿，大多数通过治疗可以达到临床治愈，不会留下什么后遗症。少数为自身免疫系统疾病导致，治疗过程中可能会出现继发感染引起并发症，但多数通过治疗也可以好转，不排除少数并发症可以导致死亡。通常通过全身药物治疗、局部手术切除，大多数患者都可以达到临床治愈。
因为是炎性肉芽肿，通常全身抗感染治疗，能够达到临床治愈。但由于结构，尤其是外周有纤维结缔组织包绕，以至于全身用药不一定能很好达到局部，起到抗感染作用。因此，必要时要依据每一个患者具体情况，采取手术切除方法，使炎性肉芽肿能够达到临床治愈。若为结核感染导致的炎性肉芽肿，尤其是在肺部，还有异物吸入肺内，以异物为中心，周围有炎性细胞浸润、上皮样细胞浸润、结缔组织包裹，局部吸收有困难，手术切除通常就可以达到治愈。