宝宝痰里有金黄色葡萄球菌，考虑呼吸道存在金黄色葡萄球菌感染的情况，具体如下：
1、不耐青霉素、头孢类药：首选青霉素类或头孢类抗生素治疗，比如阿莫西林颗粒或者头孢克肟颗粒（6个月以下禁用）。建议家长带宝宝去医院，遵医嘱做皮肤过敏试验，阴性才能服用，必要的时候可以静脉滴注，改善宝宝咳嗽、咳痰症状。
2、耐青霉素、头孢类药：如果应用青霉素类或头孢类抗生素治疗效果不好，考虑是金黄色葡萄球菌产生了耐青霉素、头孢类药性，可以遵医嘱应用万古霉素，对金黄色葡萄球菌引起呼吸道感染的治疗，改善宝宝咳嗽、咳痰的症状。用药的剂量和疗程要谨遵医嘱，用药的注意事项家长要严格掌握。