甲型流感第几天最严重主要看病情的走向，在疾病刚开始时，很难说哪天病情最重，因为流感病情的发展有不确定性。正常情况下，大部分甲流患者，在发病最初24小时内急性症状会比较明显，尤其是发热，可能会在病初24小时内体温出现迅速升高，达到39-40℃以上，症状持续1-3天，经过治疗，大概在3-5天，急性症状会消失，浑身酸痛、发热的症状会好转，甚至消失。
但是对于部分患者，咳嗽时间会持续较长，可能会持续一周，对于一些抵抗力低下的患者，比如老年人，部分症状可能会持续更久，比如全身乏力等症状，会持续10天左右。如果没有任何并发症，基本上流感情况可以在10-14天左右痊愈。
65岁以上的老年人或者小于五岁的儿童、妊娠中晚期的孕妇，平时已经有慢性病，如合并有高血压、糖尿病、冠心病的患者，是流感高危人群，一旦得流感，可能会出现各种严重的并发症。如果出现并发症，会有很长时间的病程，所以对于高危人群，要及早预防、早期用药、早期治疗。