腰椎间盘突出首诊的科室应该挂骨科，骨科医生会根据患者的临床症状、体格检查来做出相应的判断，如果诊断不清的话还可以开具腰椎CT或者腰椎核磁等影像学检查，来明确腰椎间盘突出的部位以及程度，同时骨科还具备进行一些骨科手法以及手术治疗的这些条件。所以怀疑腰椎间盘突出的患者应该首先到骨科进行治疗。
如果经过骨科诊治已经确诊了是腰椎间盘突出，并且暂时可以考虑以保守治疗为主的话，这个时候患者就可以到理疗科或者是针灸推拿科来进行物理方面的治疗。手术以后患者还需要挂康复科，进行术后的骨科康复治疗。