慢性输卵管卵巢炎是很难根治，因为慢性炎症长时间之后，容易形成纤维组织增生而导致局部粘连。
在没有形成增生和粘连的情况下，可以选择使用口服中药，中药灌肠加盆腔理疗进行治疗，比如大血藤、败酱草、丹参等活血化瘀的中药，或者直接用康复消炎栓中成药塞肛门。如果治疗及时，三至六个周期可以根治。
如果已经形成粘连，这种情况下单纯口服药物效果不太好，如果患者想根治，需要做腹腔镜或者开腹手术，将局部的粘连分离，分离后使用抗粘连的药物，术后在配合保守治疗的方法，比如使用抗生素中药的口服、灌肠等等，最少使用三至六个周期。但是，这种情况下治愈的可能性非常小，因为术后发生再粘连的几率非常大。