牙拔除时骨组织和软组织均受到不同程度的损伤，创伤造成的代谢产物，和组织应激反应产生的活化物质会刺激神经末梢，引起疼痛。除创伤外，过大的拔牙创血块易分解脱落，使牙槽骨壁上的神经末梢暴露，受到外界刺激也可引起疼痛。
一般的牙齿拔除后常无疼痛或仅有轻微的疼痛，通常可不使用止痛药物。创伤较大的牙拔除后，如下颌阻生智齿拔除后，常会出现疼痛，术后应常规使用镇痛剂，术后反应性疼痛应与干槽症相鉴别，反应性疼痛术后当日即可出现。拔牙创多正常，即使拔牙创空虚，也无腐臭，疼痛不严重，3-5天内消失。干槽症的疼痛多为3-5天后剧烈的放射性疼痛，拔牙创有腐臭，如不加处理疼痛可达十余日。