出现右侧卵巢囊肿，其原因一般不清楚，一般来讲卵巢囊肿分为真性卵巢囊肿和生理性囊肿两种。
真性卵巢囊肿其病因不十分清楚，有人说和遗传因素有关，另外有学者认为和基因突变有关，也有和感染因素有关等等。
卵巢囊肿不同的类型，其病因并不十分明了，有待于科学家进一步发现，而通常生理性囊肿原因会比较清楚，生理性囊肿常常是在月经后半期出现的，囊肿大小常常小于5cm。
这种情况，在月经以后可以消失，所以称之为生理性囊肿，和生理周期有关联，而且不是一个真性囊肿。一般来讲出现卵巢一侧的小囊肿，需要辨别是真性囊肿还是生理性囊肿。
如果怀疑生理性囊肿，可以三个月内月经后复查，如果囊肿消失了，就称之为生理性囊肿。