甲状腺功能亢进症在临床上大多数的患者可以治愈，如果在内科治疗过程中吃抗甲状腺药物治疗效果不佳，可以尝试碘-131的治疗方法，或者是尝试手术的治疗方法。如果能考虑到上述的三种方法，大部分甲状腺功能亢进症患者可以被治愈。
所谓的难治性甲状腺功能亢进症，指的是对内科治疗，也就是抗甲状腺药物治疗效果不佳，比如吃甲巯咪唑或吃丙硫氧嘧啶，控制甲状腺功能亢进症的效果不好，或者是反复复发的患者，此时应该考虑另外两种治疗办法。