衣原体是一类专性细胞内寄生的原核细胞型微生物，沙眼衣原体最常见的致病性衣原体，沙眼衣原体感染人体后可引起多种疾病，
如沙眼、包涵体结膜炎、泌尿生殖系统感染、性病性的淋巴肉芽肿、新生儿结膜炎等，尤其是泌尿生殖系统感染在临床上十分常见。
一部分患者感染后可没有任何症状和体征，但可通过性接触等行为进行传播，导致性伴侣感染。
出现症状的男性患者可表现为尿道炎，出现尿痛，尿道口瘙痒、刺痛、烧灼感，尿道有少量浆液性细胞分泌物，尿道口红肿等症状，还会引起附睾炎、前列腺炎及直肠炎等。
女性尿道炎可表现为尿频、排尿困难，另外还会引起生殖道感染，如宫颈炎、子宫内膜炎、输卵管炎及宫腔内感染等。