扁桃体结石自检的方法就是看症状，会间断的咳出黄白色的颗粒样的东西，有臭味，同时有口臭、口腔异味、咽部异物感等等症状。检查可以用干净的东西，比如筷子或者勺子将舌头压下来，可以看到咽腔两侧扁桃体上，尤其扁桃体上级会出现颗粒样的东西堵塞在隐窝口，可以用筷子头将颗粒轻轻的拨出。
如果扁桃体结石清理困难，也可以到医院让医生用扁桃体隐窝灌洗的方法，或者用专用的器械将扁桃体结石取出。如果反复长扁桃体结石，是因为慢性扁桃体炎隐窝型，这类的炎症比较严重或者反复发作，同时有口臭、口腔异味很明显，或者咽部异物感很难忍受，也可以考虑进行手术治疗，用手术的方法将扁桃体切除。