腮腺炎的诊断通常按以下程序进行，对于符合下列条件之一的患者，均应作为流行性腮腺炎疑似病例：一、单侧、双侧腮腺和其他唾液腺肿胀、疼痛，张口和咀嚼或进食酸性食物时疼痛加剧。二、符合流行病学史，如发病前14-28天，有与流行性腮腺炎患者接触史或当地有流行性腮腺炎流行，同时有发热、头痛等表现，或伴有脑膜脑炎、睾丸炎、胰腺炎。
对于同时符合疑似诊断两个条件的患者，可以作为临床诊断病例，确定诊断需要血清学和病原学检查结果之一，包括以下几点：一、疑似病例或临床诊断病例，血清中检测出腮腺炎病毒特异性IgM抗体。二、恢复期与急性期血清腮腺炎病毒IgG抗体滴度比，呈四倍或四倍以上升高或抗体阳转。三、唾液、尿液、脑脊液等体液中分离到腮腺炎病毒。