智齿及其它牙齿拔除后即刻，由于根尖血管和牙周组织的撕裂牙槽窝内出血，15-30分钟后出血停止形成血凝块，封闭创口。此血凝块的存在有保护创口、防止感染、促进创口正常愈合的功能。如血凝块脱落形成不良或无血块形成，创口愈合缓慢，出现牙槽窝感染、疼痛，并发症的可能性大大增加。拔牙后数小时牙龈收缩，这也是保护血块和促进愈合的机制，拔牙后3-4天更成熟的结缔组织开始替代肉芽组织，术后5-8天开始形成新骨。
大约38天后拔牙窝的2/3被纤维样骨质充填，三个月后才能完全形成骨组织。牙槽突功能性改进，尽管人为的将拔牙窝的愈合分为五个阶段，但实际上其中许多变化是同时交织进行的。牙槽突的改建早在术后三天就开始了，40天后愈合内逐渐形成多层骨小梁一致的成熟，并有一层密质骨覆盖这一区域。牙槽突骨受功能性压力后，骨小梁的数目和排列顺序变化重新改造，3-6个月后重建过程基本完成，出现正常的骨结构。