根管治疗补牙后存在咬合痛，可能有两种原因。第一种可能是根尖周炎治疗不够完善，根尖周还存在炎症，这种情况建议患者去正规的医院，再拍个根尖X线片确诊，是否还有根尖炎的存在。如果还有根尖炎的存在，根管治疗比较完善，患者可以做根切手术，在牙周翻瓣的情况下切除根尖周炎。如果没有根尖周炎存在，可能是因为根管治疗后，补牙的材料补的过高，导致患者有早接触而产生咬合痛，这种情况处理比较简单，可以去医院进行调和，磨除早接触点，这样很快就可以消除咬合痛。