非典型鳞状细胞高危病变的意思有可能是既有非典型鳞状细胞，又有高危HPV感染，这种情况在临床上并不严重，主要是高危HPV感染下还没有发生宫颈上皮的病变，不过也建议在月经干净3-7天做阴道镜检查，主要目的是了解在高危HPV感染下，宫颈上皮有没有发生病变，最终以病理诊断为准。
假如没有病变的情况下，只是单纯的非典型鳞状细胞，在临床上没有意义，可以定期给予复查。如果是通过阴道镜检查，通过病理化验出现宫颈上皮病变的情况下，根据病变的程度给予不同的治疗，比如低级别病变可以做激光治疗，高级别的病变可以做冷刀锥切治疗。