性生活时女方疼痛，有以下几个方面原因：
一、慢性外阴、阴道炎症，如果有炎症，组织弹性会下降、瘢痕，在性生活开始时有疼痛。
二、阴道以及宫颈器质性病变，如宫颈癌、宫颈癌前病变，这种情况下在性生活时有出血、疼痛。
三、子宫内膜异位症的疾病，这是在育龄期女性广泛存在，尤其是有痛经的女性，痛经加上性交痛，这是子宫内膜异位症的典型表现，尤其是深部性交痛，也就是在达到性高潮时，阴茎触及到宫颈后方的韧带，以及肠管位置时会有疼痛。这种病需要医生进行非常详细的查体才能明确。
当然，不管是炎症还是宫颈病变，还是子宫内膜异位症，这些都得通过详细的妇科检查，以及必要的化验检查进行判断，比如白带常规化验判断有无炎症。宫颈的HPV检测、TCT细胞学检查，判断宫颈有无病变。阴道B超加妇科查体，判断有没有子宫内膜异位症，要从上述几个方面找原因。