如果出现了甲状腺功能亢进症停药后复发的现象，部分患者可以继续采用药物治疗，大多数患者需要改为放射性碘治疗或手术切除治疗。因为停药后复发的患者继续服药，通常预后比较差，几乎不太可能用药物治愈疾病，故改用其他治疗方法不失为一种明智之举。
碘放疗和手术切除治疗是最主要的方法，对于老年人，一般情况比较好的可以选择碘放疗，也可以选择手术治疗。对于近期没有生育要求的年轻女性，可以采用放射性碘-131治疗。该方法在颈部不会留下瘢痕，也不会在术后发生一系列问题，特别是不会出现手术后的各种并发症，故被很多人采用。