肠镜检查需要的时间主要取决于肠镜检查是否顺利，如果肠镜检查顺利，一般需要10-15分钟左右，若进镜比较困难，时间会相应延长。
肠镜是一支细长可弯曲的医学仪器，直径大约1cm，结肠镜通过肛门进入直肠，直到大肠，可让医生观察到结肠和大肠的内部情况，主要是腹型肥胖，也就是过于胖的病人或者过于消瘦的病人，还有老年的妇女，这些人经历过生产，腹壁非常松弛和薄弱，肠腔非常游离，会导致进镜比较困难。此外，如果患者腹部做过手术，包括复合手术在内，会多多少少造成肠腔粘连，此类病人的肠腔可能有比较锐利的拐角，做的过程中可能会有较大的痛苦，上述因素都会造成做肠镜检查的时间延长。
患者检查后要注意进食流食或半流质饮食，忌食生、冷、硬和有刺激性的食物，不要饮酒。检查后4-6小时禁止开车、骑车，3天内避免剧烈活动和重体力劳动。